LTSkyriuje aptariama aukštųjų mokyklų valdymo ir studijų finansavimo pertvarka yra reikšminga mokslo ir studijų reformos visumos dalis. Programoje Vyriausybė sako, kad „Mokslo ir studijų sistemoje 2009 m. įgyvendinsime visus esminius mokslo ir studijų reformos darbus“ (54 punktas), nurodo šešis konkrečius darbus. Du iš jų tiesiogiai susiję su valdymo ir finansavimo pertvarka: „modernizuoti“ valstybinių universitetų valdymą, pertvarkyti studijų finansavimo sistemą. Su valdymo pertvarka susijusi ir nuostata aukštosioms mokykloms suteikti „tikrą autonomiją“. Dėl valdymo ir finansavimo aktyviau nei dėl kitų aukštojo mokslo pertvarkos temų buvo diskutuota viešumoje, jų įgyvendinimo link vedė ir daugkartiniai politiniai susitarimai ar projektai, jų atžvilgiu aiškiai išsiskyrė palaikymo koalicijos, kurios, diskutuodamos apie šiuos klausimus, brendo ir tvirtėjo. [Iš straipsnio, p. 251]